美國各地遭到不明外星生物•伊多拉的襲擊，還造成人員重大傷亡。對人類來說唯一能夠與之對抗的方法就是由伊多拉對策機構（CIO）所開發的遠距離操作武器•阿爾卡納。主角•伊利亞因車禍而失去行動的自由，當他某天被阿爾卡納所救之後，就決定要成為操縱者，因為那是他唯一能夠幫助別人的方式。然而等他成為操縱者，才明白一個更殘酷的事實：「阿爾卡納其實算是半個伊多拉，而且還是將姐姐改造成阿爾卡納」。