少女愛麗絲從睡眠中甦醒之後，發現自己身在一所陌生的學園，這裡的規矩就是不得與外界接觸。學園裡所有學生都失去了從前的記憶，而她唯一記得的也只有自己的名字，在她意外發現學園的驚人秘密後，發覺一切事物都不對勁。後來她遇見一名來自附近村落，同樣在追查學園真相的男孩，於是下定決心找尋原本的自己及真正的家，但前方卻有重重危機與黑暗等待著兩人。