小小名偵探江戶川柯南，身體雖小，其實卻有著高中生名偵探的智慧。

　　雖然被謎樣組織強行灌下毒藥，卻仍努力活用自己小小的身體，寄宿在小蘭家，代替小五郎偵辦無數棘手的案件。在小學的班上也組成了少年偵探團，似乎頗樂在其中。同伴的灰原，是一位和柯南一樣，因同樣藥物而幼兒化的少女，目前與阿笠博士住在一起。無視於小蘭的擔心，柯南所到之處發生了各式各樣的事件。柯南偶爾會與知道自己秘密的大阪府警察局長之子．服部平次攜手演出最完美的合作呢！總之，沒有名偵探柯南解不開的謎……

　　警察也是平凡人，也會喜觀上別人！而且喜歡的人，喜歡的可能是另有其人！這種情形經常發生的……高木刑警喜歡上了搜查一課的美女刑警喔！