原以為很安全的演習中，師團級魔獸——貝西摩突如其來地現身。以艾爾涅斯帝為首的萊西亞拉騎操士學園的學生們好不容易才勉強頂住牠的攻擊。戰鬥結束，他們回到平穩的日常生活中——理應如此，但艾爾涅斯帝的日子不可能平穩。在國王無理的命令下，他開始一場將童年玩伴、學校同學，甚至整個學園都捲入的大暴走。最後竟然超越了世界的常識，創造出前所未有的幻晶騎士。由奇異的知識所構成、蘊含強大力量的新型機，讓各方人馬紛紛展開行動——