認為是自己親手殺死同班同學冬二的真嗣,已經喪失回學校上課的勇氣,在漫無目的閒晃時,他遇到了神秘的美少年─渚薰,僅知他是由委員會直接送來的第5適任者,其他一切成謎。另外,缺乏獨當一面機會的明日香,因為心理壓力,表現開始失常,就在此時,使徒來襲了!這次的使徒具有能夠挖出對手心中最不堪的回憶,使其陷入「精神污染」狀態的能力。身心俱疲的明日香,被喚起童年時,母親因為父親外遇而精神錯亂最後自殺的過往,因而開始陷入瘋狂狀態。