在一個架空的日本，富士山上存在一座妖怪之城，而妖怪進入了人類社會，與人類共同生活著。多年前，因妖怪引起的事件失去了母親的稻生真琴，對妖怪恨之入骨。為此加入軍方秘密部隊「立川作業班」的她，要與妖怪攜手行動，解決各種人類與妖怪引起的事件。究竟她能不能揪出當年的幕後黑手，為母親報仇雪恨呢……？