第一輯? 中國傳統哲學

1.《周易的自然哲學與道德涵義》

2.《名家與荀子》

3.《才性與玄理》

4.《佛性與般若》

5.《心體與性體》

6.《從陸象山到劉蕺山》

7.《陸王一系之心性之學》

8.《蕺山全書選錄》



第二輯? 歷史與文化

10.《道德的理想主義》

11.《歷史哲學》

12.《政道與治道》



第三輯? 理則學

13.《邏輯典範》

14.《理則學》

15.《理則學簡本》



第四輯? 西學譯註

16.《康德「純粹理性之批判」》

17.《康德的道德哲學》

18.《康德「判斷力之批判」》

19.《名理論》

20.《牟宗三先生譯述集》



第五輯? 哲學系統之建立

21.《認識心之批判》

22.《智的直覺與中國哲學》

23.《現象與物自身》

24.《圓善論》



第六輯? 論著匯編

25.《生命的學問》(存目•闕文)

26.《時代與感受》

27.《時代與感受續編》

28.《牟宗三先生早期文集》

29.《牟宗三先生晚期文集》

30.《牟宗三先生未刊遺稿》



第七輯? 講錄

31.《人文講習錄》

32.《中國哲學的特質》

33.《中國哲學十九講》

34.《中西哲學之會通十四講》

35.《四因說演講錄》

36.《宋明儒學綜述》

37.《宋明理學演講錄》

38.《周易哲學演講錄》



第八輯? 自傳與附錄

39.《五十自述》

40. 附錄一：《牟宗三先生學思年譜》

41. 附錄二：《國史擬傳》

42. 附錄三：《牟宗三先生著作編年目錄》



(因字數問題，會有數篇收入同一冊的情形，正文共計32冊，另附一冊總敘詳目，套書總計33冊)